Due nuovi Download sono in arrivo per Captain Toad: Treasure Tracker per Nintendo Switch, il primo gratuito e il secondo a pagamento. Il primo download gratuito è stato reso disponibile subito dopo la diretta nintendo del 13 febbraio e permette di rigiocare tutti i livelli del gioco in due giocatori, trasformando Captain Toad: Treasure Tracker in un cooperativo multiplayer per due persone.
Il secondo DLC a pagamento arriverà il 14 marzo 2019 e porterà 18 nuove sfide in 5 nuovi livelli inediti, come i relitti sommersi e il mondo dei dolciumi e nuove sfide nei livelli già esistenti, che potranno essere affrontate sia da soli che in multiplayer. Effettuando il preordine dopo la diretta Nintendo è possibile inoltre già giocare in anteprima ad uno dei nuovi livelli.