Per ricevere le missioni si dovrà parlare con il caposquadra ed accedere alla bacheca, e poi giocare al relativo livello,e se completato si riceveranno delle monete come premio. I livelli da affrontare sono più di 100, tutti originali e creati da Nintendo. Come già detto prima in questi livelli si troveranno una gran quantità di elementi, strumenti e funzionalità, e giocando si potranno vedere questi all’opera imparando così ad utilizzarli nella creazione avanzata dei livelli.
Più si va avanti in questa modalità più Mario potrà accedere a nuove aree e si potranno incontrare alcuni personaggi che potrà dare delle missioni secondarie.
Super Mario Maker 2 sarà disponibile per Nintendo Switch a partire dal 28 giugno 2019.